Калпонин гомологиясының домені - Calponin homology domain - Wikipedia

Калпонин гомологиясы (CH) домені
2RR8.pdb.jpg
IQGAP1 кальпонин гомологиясының доменінің ерітінді құрылымы[1]
Идентификаторлар
ТаңбаCH
PfamPF00307
InterProIPR001715
SMARTCH
PROSITEPDOC00019
SCOP21аоа / Ауқымы / SUPFAM
CDDCD00014

Калпонин гомологиясының домені (немесе CH домені) отбасы актин цитоскелеттік ақуыздарда да, сигналдық трансдукциялы ақуыздарда да кездесетін байланыстырушы домендер.[2] Доменнің ұзындығы 100-ге жуық амин қышқылдары және төрт альфа-спиралдан тұрады.[3] Ол актинмен байланысатын домендердің келесі топтарын қамтиды:

Актинмен байланысатын осы типтегі домендерді қамтитын ақуыздарға жан-жақты шолу жасалған.[4]

CH домені отбасының кейбір мүшелерінде актинмен байланысуға қатысады. Алайда, калпониндерде CH доменінің оның актинмен байланысу белсенділігіне қатысы жоқ екендігі дәлелденген.[5] Көптеген ақуыздарда CH доменінің екі көшірмесі бар, бірақ кальпонин және адам вав прото-онкоген сияқты кейбір ақуыздар (P15498) тек бір данасы болуы керек. Мысал ретінде CH доменінің құрылымы анықталды Рентгендік кристаллография.[6]

Мысалдар

Кальпонин гомологты доменді ақуыздарды кодтайтын адам гендеріне мыналар жатады:

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ PDB: 2RR8​; Умемото Р, Нишида Н, Огино С, Шимада I (қыркүйек 2010). «Адамның IQGAP1 кальпонин гомологиясының доменінің NMR құрылымы және оның актинді тану режиміне салдары». J. Biomol. NMR. 48 (1): 59–64. дои:10.1007 / s10858-010-9434-8. PMID  20644981. S2CID  25649748.
  2. ^ Saraste M, Castresana J (1995). «Vav CH домені арқылы F-актинмен байланысады ма?». FEBS Lett. 374 (2): 149–151. дои:10.1016 / 0014-5793 (95) 01098-Y. PMID  7589522. S2CID  29667309.
  3. ^ Коренбаум, Е .; Rivero, F. (қыркүйек 2002). «Кальпонин гомологиясының домендері бір қарағанда». J ұялы ғылыми жұмыс. 115 (Pt 18): 3543-5. CiteSeerX  10.1.1.608.8653. дои:10.1242 / jcs.00003. PMID  12186940. S2CID  38137068.
  4. ^ Хартвиг ​​Дж.Х. (1995). «Актинмен байланысатын ақуыздар. 1: Спектрин супер отбасы». Протеин Проф. 2 (7): 703–800. PMID  7584474.
  5. ^ Gimona M, Mital R (1998). «Кальпониннің жалғыз CH домені F-актинмен байланысу үшін жеткіліксіз де, қажет те емес». J. Cell Sci. 111: 1813–1821. PMID  9625744.
  6. ^ Saraste M, Carugo KD, Banuelos S (1997). «Калпонин гомологиясының кристалдық құрылымы». Нат. Құрылым. Биол. 4 (3): 175–179. дои:10.1038 / nsb0397-175. PMID  9164454. S2CID  1428195.
Бұл мақалада көпшілікке арналған мәтін енгізілген Pfam және InterPro: IPR001715