TRIM37 - TRIM37 - Wikipedia

TRIM37
Қол жетімді құрылымдар
PDBОртологиялық іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарTRIM37, MUL, POB1, TEF3, құрамында 37 бар үш жақты мотив
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 605073 MGI: 2153072 HomoloGene: 9084 Ген-карталар: TRIM37
Геннің орналасуы (адам)
17-хромосома (адам)
Хр.17-хромосома (адам)[1]
17-хромосома (адам)
TRIM37 үшін геномдық орналасу
TRIM37 үшін геномдық орналасу
Топ17q22Бастау58,982,638 bp[1]
Соңы59,106,921 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
PBB GE TRIM37 213009 s at fs.png
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_197987
NM_001363025
NM_001363026
NM_001363027
NM_001363028

RefSeq (ақуыз)

NP_932104
NP_001349954
NP_001349955
NP_001349956
NP_001349957

Орналасқан жері (UCSC)Хр 17: 58.98 - 59.11 МбChr 11: 87.13 - 87.22 Mb
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

Құрамында үш жақты мотив бар ақуыз 37 болып табылады E3 ubiquitin ligase кодталған адамдарда TRIM37 ген.[5][6][7][8]

Функция

Бұл ген мүшесін кодтайды үшжақты мотив (TRIM) отбасы, оның мүшелері әр түрлі жасушалық функцияларға қатысады, мысалы дамудың үлгілері және онкогенез. TRIM мотивіне кіреді мырышпен байланыстыратын домендер, RING саусақ аймағы, a B-бокс мотиві және а ширатылған домалақ домені. RING саусақтары мен B қораптарының домендері хелат мырыш болып табылады және олар ақуыз-ақуыз және / немесе ақуыз-нуклеин қышқылының өзара әрекеттесуінде болуы мүмкін. Гендік мутациялар байланысты мулибрей (бұлшықет-бауыр-ми-көз) нанизм, аутозомдық-рецессивті бұзылыс, оған бірнеше тіндер кіреді мезодермальды шығу тегі. Баламалы түрде бір протеинді кодтайтын транскрипт нұсқалары анықталды.[7] Ол моно- үшін жауап бередібарлық жерде туралы гистон H2A сағ лизин 119, әдетте байланысты модификация транскрипциялық репрессия.[8][9]

Сүт безі қатерлі ісігінің рөлі

Болатын 17q23 хромосомалық аймақ TRIM37 геннің орналасуы сүт безі қатерлі ісіктерінің 40% -ында күшейетіні көрсетілген.[10] TRIM37 ақуызы кеудеге әсер етеді деп саналады қатерлі ісік онкогенезі Ісікті басатын гендер орналасқан аймақтарда H2A гистонын тарату арқылы, ісікті басатын гендердің бұл репрессиясы ісіктің пайда болу ықтималдығын немесе бар ісіктің агрессивті болуын күшейтеді.[8]

Өзара әрекеттесу

TRIM37 көрсетілген өзара әрекеттесу бірге ҚХР1.[11] TRIM37-нің PRC2-мен өзара әрекеттесуі оның ерекшелігін және қашан өзгеретінін көрсетті TRIM37 шамадан тыс әсер етсе, ген экспрессиясының көптеген өзгерістері бар, олар ісікті басатын гендердің тынышталуына әкеледі.[8] Сондай-ақ, TRIM37, PRC2, PRC1 мақсатты гендермен бірігіп, олардың транскрипциялық репрессиясына әкеліп соқтыратыны көрсетілген. Нокдаун TRIM37 РНҚ-интерференциясы арқылы экспрессия H2A-ның барлық жерде бөлінуіне және PRC1 мен PRC2-нің мақсатты гендерден бөлінуіне әкелетіндігін көрсетті. Бұл өзгерістер мақсатты геннің транскрипциялық белсенді болуына мүмкіндік береді.[8]

Сондай-ақ қараңыз

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б в GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000108395 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б в GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000018548 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ Авела К, Липсанен-Найман М, Перхентупа Дж, Уоллгрен-Петрссон С, Марчанд С, Фауре С және т.б. (Сәуір 1997). «Мульибрей нанизмінің генін 17q-ге байланыстыру және тепе-теңдік талдау арқылы тағайындау». Американдық генетика журналы. 60 (4): 896–902. PMC  1712467. PMID  9106536.
  6. ^ Avela K, Lipsanen-Nyman M, Idänheimo N, Seemanová E, Rosengren S, Mäkelä TP және т.б. (Шілде 2000). «Жаңа RING-B-box-Coiled-coil протеинін кодтайтын ген мулибрей нанизмінде мутацияға ұшырады». Табиғат генетикасы. 25 (3): 298–301. дои:10.1038/77053. PMID  10888877. S2CID  24257747.
  7. ^ а б «Entrez Gene: TRIM37 үш жақты мотиві бар 37».
  8. ^ а б в г. e Бхатнагар С, Газин С, Чемберлен Л, Оу Дж, Чжу Х, Тушир Дж.С. және т.б. (Желтоқсан 2014). «TRIM37 - бұл жаңа гистон H2A ubiquitin ligase және сүт безі қатерлі ісігі онкопротеині». Табиғат. 516 (7529): 116–20. Бибкод:2014 ж. 516..116B. дои:10.1038 / табиғат13955. PMC  4269325. PMID  25470042.
  9. ^ Уик В.М., Workman JL (наурыз 2008). «Гистонды увикутациялау: гендік белсенділікті қозғау». Молекулалық жасуша. 29 (6): 653–63. дои:10.1016 / j.molcel.2008.02.014. PMID  18374642.
  10. ^ Синклер, Коллин С .; Роули, Мэтью; Надери, Әли; Couch, Fergus J. (2003-04-01). «17q23 ампликон және сүт безі қатерлі ісігі». Сүт безі қатерлі ісігін зерттеу және емдеу. 78 (3): 313–322. дои:10.1023 / A: 1023081624133. ISSN  1573-7217. PMID  12755490. S2CID  23751525.
  11. ^ Rual JF, Венкатесан К, Хао Т, Хирозане-Кишикава Т, Дрикот А, Ли Н және т.б. (Қазан 2005). «Адамның протеин-протеинмен өзара әрекеттесу желісінің протеома-масштабты картасына қарай». Табиғат. 437 (7062): 1173–8. Бибкод:2005 ж. 437.1173R. дои:10.1038 / табиғат04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.

Әрі қарай оқу

Сыртқы сілтемелер

  • Сайтында қол жетімді барлық құрылымдық ақпаратқа шолу PDB үшін UniProt: O94972 (E3 убиквитин-протеинді лигаз TRIM37) PDBe-KB.